彩陶是跨湖桥文化最重要的特征之一。迄今发掘的东南沿海地区新石器时代遗址中，尚无其它遗址出现如此丰富的彩陶。

跨湖桥遗址中，早期彩陶的主要形式为盘内薄彩，表现手法已经较为成熟。晚期薄彩、厚彩并存，彩纹丰富而规范，主要施于罐、圈足盘、豆三种器形。彩纹作于陶衣之上，特殊的是，装饰图案一般施在自上而下可以看到器物的外肩部或盘内壁，反映出跨湖桥人对视觉艺术的自觉追求。同时也证明8000年前跨海桥人已经掌握了自然颜料在高温烧制过程中化学变色的原理。

另外，跨湖桥遗址出土的彩陶器上多见圆圈、放射线等组合图案，这些图案都是以太阳为模仿题材的，但表现形式较为直接而质朴。跨湖桥文化时期，太阳一天中的东升西落，一年四季中的高低变化以及由此产生的冷暖效应，都会对人类的生产、生活乃至于生命产生巨大的影响，也在原始先民的心目中幻化出许多美丽的幻想，从而催化出人类最原始的宗教——太阳崇拜。到了河姆渡、良渚时期，太阳崇拜的表现形式更加抽象而繁复。

跨湖桥遗址彩陶中所见的太阳纹和火焰纹图案是南中国地区所见最早形式的太阳崇拜。