杭州孔庙坐落于上城区府学巷八号。现占地面积1.32公顷，总建筑面积5581平方米。功能布置分孔庙建筑群与杭州碑林两大区块。

南宋建炎三年（1129年)宋高宗赵构升杭州为临安府。绍兴元年（1131年），依照“庙学合一”规制，孔庙作为主要功能建筑与临安府学一起迁建至现址。绍兴12年1142年。府学曾一度增修为南宋最高学府--太学。元代将学宫称为庙学，临安府学称为杭州路庙学。明代，又将庙学改称为府学。至此，杭州府学历经元明清三朝。几经修缮，扩建成“左庙右学”布局，沿革有序。

清光绪三十一年1905年废除科举，杭州府学退出历史舞台，孔庙作为祭孔场所留存。

新中国成立后，杭州孔庙成为文物部门存放碑石的场所。1989年，杭州孔庙整修改建，以杭州碑林为名对外开放。2008年，杭州孔庙原址复建对外开放。2019年，杭州孔庙碑林被国务院公布为第八批全国重点文物保护单位。

今天，杭州孔庙碑林即是开展爱国主义教育的重要基地，也是展示杭州宋韵文化的重要窗口，还是祭祀孔子的主要场所。