杭州地铁决定从4月23日起，16号线绿汀路站末班车发车时间从23:00延长到23:15（即额外增加一列载客列车），最大程度保障乘客出行。

自16号线开通至今，乘客越来越多，早晚高峰十分拥挤。2023年，杭州地铁16号线日均客流在6万人次左右。2023年4月28日，16号线客流量达到8万多人次，成为去年客流量最高一天。

目前，16号线进出站客流前三的站点分别为青山湖科技城站、禹航路站、临安广场站。16号线的客流量高峰大多集中在早晚高峰，这也表明，它已成为一条真正的“通勤线”，而越来越多的年轻人，也选择了在临安区安家。