杭州段首批遗产点段共有11个，包括富义仓、凤山水城门遗址、桥西历史街区、西兴过塘行码头、拱宸桥、广济桥这6个申遗点，以及杭州塘段、江南运河杭州段、上塘河段、杭州中河-龙山河、浙东运河主线等5段河道。

富义仓

位于京杭大运河主航道与胜利河交汇处，初建于清光绪六年（1880年），竣工于光绪十年（1884年），用于粮食的收储与转运，是杭州城北部地区重要的仓储建筑群。它与北京的南新仓并称为“天下粮仓”，有“北有南新仓，南有富义仓”之说。

民国时期，改为浙江省第三积谷仓，短时做过国民党军用仓库。解放后，杭州市粮食公司接管，作为民生仓库分库，是杭州塘运河沿岸保存较完整的古代城市公共仓储建筑，也是杭州现存唯一的一个古粮仓，还是目前申报的元明清运河中仅有的仓储设施遗存。

现大部分仓廒保存原有格局，是研究古代仓储制度的重要实物例证。它是杭城湖墅地区历史上米市、仓储和码头装卸业等经济业态曾经发展、繁荣的实体见证，是杭州运河文化系统的有机组成部分。

凤山水城门遗址

杭州中河—龙山河上的古代水城门，处于杭州古城南端，位于中山南路与中河路交会处，东西向横跨中河。凤山水城门是杭州古代五水门中唯一尚存的一座,具有历史地标作用,是研究杭州城池变迁的坐标。杭州段运河河道线型、尺度及驳岸等因城市变迁和航运发展而改变,唯凤山水城门下近二十米的河道保留元明时期原状,十分可贵，现作为杭州城墙遗址的一部分对公众开放。

桥西历史街区

位于京杭大运河（杭州段）主航道西岸、拱宸桥西侧，是清朝、民国以来的沿运河古镇民居建筑保存最为完整的地带，也是京杭大运河杭州段历史遗存较为集中的区域。它反映了清末民国初地方城市建设的风貌特色及自然环境特色，保存着近代工业发展过程中的生产厂房、生产工具及航运机械，还保存了饮食、礼仪、民俗、伦理等社会文化载体，至今仍然是杭州北部重要的居住区和商业区。

西兴过塘行码头

处在浙东运河杭州萧山—绍兴段中，位于西兴老街官河沿岸，浙东运河的端头，是沟通钱塘江与浙东运河的运输枢纽。过塘行，即转运栈，一般都设于水陆码头、交通要道，门面不大，一两层房屋，两三开间门面而已，主要是起到票据交换，货物中转的作用，过塘行本身并不需要类似仓储功能的建筑。

数百年来，浙东地区的粮食、棉花、丝绸、盐酒和山货在西兴过塘，转运到中原各地。西兴码头、河道、永兴闸遗址、浙东运河之头、大城隍庙遗址是浙东入境首个交通枢纽的重要见证。现因钱塘江河道北移，码头失去原有的运输功能，相关水工设施作为遗址保存完好。

拱宸桥

位于杭州北部的大运河杭州塘上、杭州市区大关桥之北，东连丽水路、台州路，西接桥弄街，是京杭大运河到杭州的终点标志。拱宸桥东西向横跨京杭大运河(杭州段)主航道，为三孔驼峰薄拱薄墩联孔石拱桥，总长98米，桥面中部宽5.9米，桥身高约16米。

拱宸桥始建于明崇祯四年（1631年），清光绪十一年（1885年）重建，中间几经兴废。拱宸桥建成后，周边逐渐形成街市，是运河沿岸航运、个体工商业者、近代产业工人的聚居区和杭州近代重要的商业中心，现保存完整，仍在使用。

广济桥

初建于明弘治年间（15世纪末），今桥为清康熙年间(17世纪末)重修。曾名通济桥、碧天桥，俗称长桥。位于杭州塘沿线的塘栖古镇上，是大运河上保存较好的薄墩联拱七孔实腹拱桥，也是大运河上保存资金规模最大的薄墩联拱石桥。全长78.7米，面宽5.2米，七孔，拱券纵联并列分节砌筑。拱券上刻有“弘治二年”纪年。 如今广济桥势如长虹，造型秀丽，历经500余年仍雄踞大运河之上，保存完好。